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PCR實驗室入門級別的知識要點

發(fā)表時間:2022/4/7  |  點擊率:2322

一、PCR實驗室的設計原則
原則上應當設置4個區域:試劑儲存和準備區、標本製備區(qū)、擴增區、擴增產物分析(xī)區。
根據使用儀器的功能,區域(yù)可適當合並。
使用實時(shí)熒光PCR儀(yí),擴增區(qū)、擴增產物分析區可合並(bìng);
采用樣本處理、核酸提取及擴增檢測為一體的自動化分析儀,則標本製備區、擴增(zēng)區、擴增產物分析區可合(hé)並。
各區功能準備物品清單:
1、試劑儲存和準備區(1區)
功(gōng)能:貯存試劑的製(zhì)備、試劑的分裝和擴增反應混合液的準備,以及離心(xīn)管、吸頭等消(xiāo)耗品的貯存和準備。
準備物品:
128-20以下冰箱
2混勻器
3微量加樣器(覆蓋0.2-1000µl
2標(biāo)本製備區(2區)
功(gōng)能:核酸(RNADNA)提取(qǔ)、貯存及其加入至擴增反應管。對於涉及臨床樣(yàng)本的操作,應符合生物安全二級實驗室防護設備、個人防護(hù)和操作規範的要求。
準備物品(pǐn):
12-8冰箱、-20-80冰箱(xiāng)
2)高(gāo)速離心機
3)混勻器
4)水浴箱或加(jiā)熱模塊
5)微量加樣器(覆蓋0.2-1000µl
6)生物安全櫃(guì)。
3、擴增區(3區)
功能:cDNA合成、DNA擴增及檢測。
準(zhǔn)備物品(pǐn):核酸擴增儀(或熒光定量PCR儀)
4、擴增產物分析區(qū)(4區)
功(gōng)能:擴增片段(duàn)的進一步分析測定,如雜交、酶切電泳、變性高效液相分析、測序等。
準備物品:
1雜交(jiāo)儀、電泳(yǒng)儀、測序儀等
(2)微量加樣器(覆蓋0.2-1000µl)
通用物品:(4個區都有(yǒu)可能需要)
(1)可移動紫外燈(近工作台麵)
(2)消耗品:一次性(xìng)手套、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(tóu)
(3)專(zhuān)用工作(zuò)服和工作鞋(xié)(套)
(4)專用辦公用品
(5)樣本管架(2區)
(6)防爆夾(2區)
(7)PCR管架(2區、傳遞窗)
二、PCR實驗室工作基本原則
1、進入各工作區域應當嚴格按照(zhào)單一方(fāng)向進行(háng)
試劑儲存和準備區→標本製備(bèi)區→擴(kuò)增區→ 擴增產物分析(xī)區。
2、各工作區域必須有明確的標記,不同工作區域內的設備、物品不得混用。
3、不同的(de)工作區域使用不同的工作(zuò)服(例如不同的顏色)。工(gōng)作人員離開各工作區域時,不得將工作服(fú)帶出。
4、實驗室的清潔應當按試劑貯存和準備區→標本製備(bèi)區→擴增區→擴增產物分析區的方向進行。不同的實驗區域應當有其各自的清潔用具以防止交叉汙染。
5、工作結束後,必須立即對工作區進行清潔。工作區的實驗台表麵應當可耐受諸如次氯酸鈉的化學(xué)物質的消毒(dú)清(qīng)潔作用。實驗(yàn)台表麵的紫外照射應當方便有效。由於紫外照射的距(jù)離和能量對去汙染的效果(guǒ)非常關鍵,因此可使用可移動紫(zǐ)外燈(254nm波長),在工作完成後調至實(shí)驗台上60~90cm內照射。由於擴增產物僅幾百或幾十(shí)堿基對(bp),對紫外線損傷不敏(mǐn)感,因(yīn)此紫外照射擴(kuò)增片段必須延長照射時間,最好是照射過夜。
6、實驗室的安全(quán)工作製度或安全標準操作程序,所有操作(zuò)符合《實驗室生物安全通用要求》(GB19489-2008)。
三、注意事項
1、試劑儲存和準備區
貯(zhù)存試劑和用於標本製備的消耗品等材料(liào)應當直接運送至試劑貯存和準備區,不能經過擴增檢測區,試劑盒中的陽性對照品(pǐn)及質控品不(bú)應當保(bǎo)存在(zài)該區,應(yīng)當保存在標本處理區。
2、標本製備區
由於(yú)在樣本混合、核(hé)酸純化過程中可能會發生氣溶膠所致的汙(wū)染,可通過在本(běn)區內設立正壓條件,避免從鄰近區進入本區的氣溶膠汙染。為避免樣本間的(de)交叉汙(wū)染,加入待測核酸後,必須蓋好含反應(yīng)混合液的反應管。對具有(yǒu)潛在(zài)傳染危險性的材料,必須在生物安(ān)全櫃(guì)內開蓋,並有明確的樣本處理和滅活程序。
3、擴增區
為(wéi)避免氣溶膠(jiāo)所致的汙染,應當盡量減少在本區內的走動。必須注意的是(shì),所有經過檢測的反應管不得在此區域打開。
4、擴增產物分析區
核酸擴增後產物的分析方法多種多樣,如膜上或微孔板或芯(xīn)片上探針(zhēn)雜交方法(fǎ)(放射性核素標記或非放射性核(hé)素標(biāo)記)、直接或酶切後瓊(qióng)脂糖凝膠電泳、聚丙烯酰胺凝膠電泳、Southern轉移、核酸測序方法、質譜分析等。本區是最主要的擴增產物汙染來源,因此必須注意避(bì)免通過(guò)本區的(de)物品及工作服將擴增產物帶出。在使用PCR-ELISA方法(fǎ)檢測擴增產物(wù)時,必須(xū)使用(yòng)洗板機洗板,廢(fèi)液必須收集至1 mol/L HCl中(zhōng),並且不能在(zài)實驗(yàn)室內傾倒,而應當至遠離PCR實驗室(shì)的地方棄掉。用過的(de)吸頭也必須放至1 mol/L HCl中浸(jìn)泡後(hòu)再放到垃圾袋中按程序處理,如焚(fén)燒。由於本區有可能會用到某些可致基因突(tū)變和(hé)有毒物質如溴化乙錠、丙烯酰胺、甲醛或放射性(xìng)核素等,故應當注意實驗(yàn)人員的安全防護。


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